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1.1 服务器
super computer 或 server
1.2 组学数据分析
组学数据#xff1a;如基因组学、转录组学、蛋白质组学等#xff1b; 上游分析#xff1a;主要涉及原始数据的获取和初步处理#xff0c;计算量大#xff0c;消耗的资源较多#xff0c;在服务器完…一、基础知识
1.1 服务器
super computer 或 server
1.2 组学数据分析
组学数据如基因组学、转录组学、蛋白质组学等 上游分析主要涉及原始数据的获取和初步处理计算量大消耗的资源较多在服务器完成。Linux 下游分析在上游分析的基础上对数据后续的分析和可视化。例差异分析、富集分析、生存分析等。R或Python
1.3 个人电脑连接服务器
使用Xshell或git或MobaXterm 输入 ssh 用户名IP地址 比如 ssh xiaoxiao101.102.103.104
二、Linux常用的基础命令
2.1 pwd
pwd: print working directory也就是显示当前路径
2.2 mkdir
mkdir make directory-- 创建空目录
mkdir biosoft #存放生信软件
mkdir project #存放生信项目
mkdir tmp #存放一些杂七杂八
mkdir src #存放源代码2.3 ls
ls : list 列表显示当前路径下的文件 ls -l 显示详细信息
2.4 cd
cd : change directory 更改路径进入一个目录 返回上一级目录
cd ..返回家目录
cd ~2.5 vi
vi : visual interface 新建脚本或者文本文档vi是Linux中的文本编辑器
vi hello_world.txt
#英文输入法然后敲i键就可以输入了
#输入想要的内容
#按Esc键退出编辑状态
#输入:wq 保存并退出 (write quit)2.6 cat
cat : 显示文件内容或连接多个文件并显示 (concatenate)
cat hello_world.txt2.7 cp
cp: 复制文件, copyLinux中一切都是文件。
2.8 mv
mv: 移动文件到指定路径 (move)
2.9 rm
rm : 删除文件 (remove)
rm # 删除文件
rm -f # 删除目录
rm -rf # 删除层级目录三、一些有用的命令
1. 查看文件大小
ls -lh2. 查看系统版本、内存与硬盘空间
cat /etc/os-release # 查看系统版本
free -h # 查看内存信息
df -h # 查看硬盘空间3. 建立类似 /tmp0/tmp1/tmp1.1 的层级目录
mkdir -p /tmp/tmp1/tmp1.1
