织梦 做网站 知乎,wordpress 网校主题,同ip网站做排名seo,怎么注册logo商标本期教程原文#xff1a;使用最简单方法添加显著性ggsignif包
本期教程 获得本期教程代码和数据#xff0c;在后台回复关键词#xff1a;20240605 小杜的生信笔记#xff0c;自2021年11月开始做的知识分享#xff0c;主要内容是R语言绘图教程、转录组上游分析、转录组下游…本期教程原文使用最简单方法添加显著性ggsignif包
本期教程 获得本期教程代码和数据在后台回复关键词20240605 小杜的生信笔记自2021年11月开始做的知识分享主要内容是R语言绘图教程、转录组上游分析、转录组下游分析等内容。凡是在社群同学可免费获得自2021年11月份至今全部教程教程配备事例数据和相关代码我们会持续更新中。 往期教程部分内容 代码
##
library(ggplot2)
library(tidyverse)
library(ggpubr)
library(dplyr)
library(multcompView)
library(ggbreak)
library(data.table)数据
#数据
set.seed(123) # 设置随机种子以确保结果可重复
samples - c(CK, 80-1, 4-7, 4-14, 4-60, 20-7, 20-14, 20-60)
mean_values - c(3, 2.5, 4, 2, 1.5, 4.5, 2.8, 3.5)
data_matrix - data.frame(sample rep(samples, each 6),value unlist(lapply(mean_values, function(mu) rnorm(6, mean mu, sd 0.3)))
)若是宽数据转换长数据即可可看我们的教程https://mp.weixin.qq.com/s/i8x0WTcXTrVgD7NGBE3hcA
绘图
##固定因子
data_matrix$sample - factor(data_matrix$sample, levels c(CK,80-1,4-7,20-7,4-14,20-14,4-60,20-60))ggplot(data_matrix, aes(x sample, y value, fill sample)) stat_summary(fun.data mean_sd, geom errorbar, width 0.15, size 1) geom_bar(color black, stat summary, fun mean, position dodge, size 0.5) ##Y轴从0开始scale_y_continuous(expand c(0,0))#theme_classic()#theme_test(base_size 14)theme_bw(base_size 14)## 差异比较组合stat_compare_means(comparisons list(c(CK,80-1),c(CK,4-7),c(CK,4-14),c(CK,4-60),c(CK,20-7),c(CK,20-14),c(CK,20-60)),tip.length 0.02,method wilcox.test, ## t.test wilcox.testanovakruskal.testlabel p.format ## p.signif显示显著性星号,p.format显示数字)scale_fill_manual(values c(#1f78b4,#ff7f00,#4daf4a,#fb8072, #8da0cb,#bf5b17,#b2df8a,#c8c9c9,#7570b3))labs(x NULL,y Expression level of genes (FPKM))theme(#axis.line element_line(size 1), ## 粗细textelement_text(#family sans,colour black,size 10),axis.text.x element_text(color black, size 10),axis.text.y element_text(color black,size 10),axis.ticks element_line(colour black),strip.text element_text(color black,size 10),axis.title element_text(color black,size 12), ##坐标轴字体大小legend.position none,strip.background element_blank()) 本期教程原文使用最简单方法添加显著性ggsignif包 获得本期教程代码和数据在后台回复关键词20240605 若我们的教程对你有所帮助请点赞收藏转发这是对我们最大的支持。 往期部分文章
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